上海健康医学院学生工作部（学生处）、武装部是学校党委和行政领导下专门负责全校学生思想政治教育和管理的职能部门，主要职责涵盖在校学生思想政治教育和日常行为管理、学生资助政策宣传、资助政策体系完善和资助育人建设、大学生心理健康教育、辅导员队伍建设、就业创业指导服务、学生征兵和军训工作等。